הבעיה בדוקטורט הפכה לסטארטאפ, ועכשיו מיקרוסופט משקיעה בו

השימוש בפלטפורמה של Code Ocean מאפשר לחוקרים להתמקד במחקר, במקום להתעסק בכל הצדדים הטכניים של ניהול המידע ותפעול התשתית החישובית

עבודה משותפת בין מדענים על מדע חישובי בסביבת ענן היא חובה בדרך לפריצות דרך משמעותיות היום. אבל בפועל, המדענים נאלצים להשקיע זמן רב בתיפעול סביבת הענן בכל מה שקשור לגישה לביג דאטה, להרים ולהוריד מכונות מיחשוב, להתמודד עם דרישות תוכנה ושמירה של גרסאות ועוד. הסטארטאפ הישראלי Code Ocean חושב שיש לו את הפתרון לבעיה הזו והיום (ד') הוא גם מודיע על השקעה חדשה שקיבל ממיקרוסופט.

בעיה בשיתוף הפעולה בין החוקרים

הרעיון להקמת קוד אושן הגיע לאחר תקופת הדוקטורט של סיימון אדר, אחד המייסדים, באוניברסיטת תל אביב, כאשר שיתף פעולה עם סוכנות החלל הגרמנית ומעבדות מחקר באירופה, "חלק מרכזי של הפרויקט היה שיתוף פעולה בין המרכזים השונים," מספר אדר. "כל מעבדת מחקר היתה מובילה בתחומה. חלק היו מהמובילים בעולם בלמידה חישובית, חלק במודלים גיאולוגיים, חלק בחישוביות גיאומטרית וכו. אבל לא ממש הצלחנו להעביר ממעבדה אחת לשניה את התשתית החישובית בכדי שנוכל להשתמש בה במעבדה אחרת בצורה פשוטה ומהירה. וכך שיתוף הפעולה היה מוגבל ביותר ובפועל כל מעבדה עבדה בצורה מבודדת בעיקר. שיתוף הפעולה התמצה בלחבר את הפרקים השונים למסמך אחד". הפתרון: קוד אושן תפתח תשתית לצורך מדע חישובי שניתן לשתף בצורה פשוטה עם לינק, בלי קשר לגודל המידע, עד כמה מורכבת הסביבה מבחינת דרישות תוכנה שמותקנות וכמה כוח חישובי נדרש,

בשיחה עם גיקטיים מספר סיימון אדר, שותף-מייסד ומנכ"ל החברה, שהחברה בחרה לעשות זאת בעזרת הרחבה של קונטיינר Docker. מדובר בקונטיינר חדש למדע חישובי, שמכיל כל מה שצריך על מנת לשחזר ניסויים מדעיים בעזרת מיחשוב: "לטכנולוגיה קוראים Compute Capsule והיא מכילה את הקוד, המידע והסביבה החישובית. הטכנולוגיה מאפשרת למדען להתרכז בעבודה המדעית עצמה ולה בכל מה שמסביב בתפעול סביבת הענן".

תמונה: Vered Adir

הפלטפורמה של קוד אושן פועלת בשני מישורים: הראשון הוא שימוש פרטי של חברות ומכוני מחקר; והשניה הוא חלק פתוח, שכולל 2,500 קפסולות מחקר ציבוריות שזמינות בקוד פתוח שבו חוקרים חולקים את הידע עם הקהילה העולמית. בחברה מספרים כי חברות ביו-פארמה דוגמת Sema4, Lantern, Champions Oncology, CytoReason, Dragonfly Therapeutics כבר עושות שימוש במוצר שלה.

מדענים וחוקרים כיום יכולים להשתמש היום בשפות וכלי קוד פתוח דוגמת Jupyter Notebook או RStudio. מה החידוש שאתם מציעים?

"החיבור הזה דורש פיתוח או פעולות ידניות רבות ומסובכות מדי למדען. הן מאוד מתסכלות ולוקחות זמן רב. לרוב המדענים אין את הכישורים ובמיוחד הרצון להתעסק בפרטים האלה. קוד אושן היא המעבדה הוירטואלית הראשונה למדע חישובי. לחברה יש מוצר שהוא פתוח וחינמי לקהילה המדעית ומחובר למפרסמים מדעיים כמו Nature ומוצר Enterprise לחברות עם מחלקות מחקר. אנחנו מאוד ממוקדים בעולם הביוטק היום שמתעסקים עם ניתוח מידע Genomics גדול".

עוד סיפורים כאלו מחכים לכם עכשיו עוד סיפורים כאלו מחכים לכם עכשיו בערוץ העדכונים הרשמי של גיקטיים

Code Ocean הוקמה על ידי סיימון אדר, מנכ"ל החברה; ורם דיין, סמנכ"ל טכנולוגיה, שכבר מכר חברה ל-Harman (היום סמסונג) והיא מעסיקה 35 עובדים, רובם במרכז הפיתוח בתל אביב. סבב הגיוס הנוכחי בגובה 16.5 מיליון דולר הובל על ידי קרן M12 של מיקרוסופט וקרן Battery Ventures, והוא מעמיד את סך גיוסי ההון של החברה מאז הקמתה על 37.5 מיליון דולר.

 

יניב אביטל

עורך אתר גיקטיים. יש לכם רעיון לכתבה? טיפ סודי? הדלפה? מחכה לכם ב[email protected]

הגב

רוצה להיות הראשון להגיב?

avatar
Photo and Image Files
 
 
 
Audio and Video Files
 
 
 
Other File Types
 
 
 

* היי, אנחנו אוהבים תגובות!
תיקונים, תגובות קוטלות וכמובן תגובות מפרגנות - בכיף.
חופש הביטוי הוא ערך עליון, אבל לא נוכל להשלים עם תגובות שכוללות הסתה, הוצאת דיבה, תגובות שכוללות מידע המפר את תנאי השימוש של Geektime, תגובות שחורגות מהטעם הטוב ותגובות שהן בניגוד לדין. תגובות כאלו יימחקו מייד.

wpDiscuz

תגיות לכתבה: